Когда Минский МОЦ только начал свою деятельность, его философию определяла, прежде всего, идея совместного осмысления истребительной войны 1941-1944 гг. и стремление к примирению. Кроме того, в связи с трудными процессами трансформации в Республике Беларусь и долгосрочными последствиями Чернобыльской катастрофы на передний план в образовательной работе центра вышла организация политического и экономического диалога белорусов с ближними и дальними европейскими соседями, а также внутреннего диалога между разными общественными силами в Беларуси. Одновременно на фоне прогрессирующих процессов глобализации, которые неизбежно захватывают и Беларусь, особое значение имеет разработка и обоснование перспектив Беларуси с точки зрения ее места в общеевропейском доме.

Важнейшими целевыми группами при этом являются свидетели военных событий, молодёжь, политики, журналисты, эксперты, а также работающие в совместных проектах граждане.